所谓“本能”和“生理”现象，看上去包含“身”“心”两方面的内容，但归根结底是“心”的问题，因为在佛学里，“身”不过是“心”的外在反映而已。

有人问：“那为什么我们大脑受伤，有可能会影响我们的心智呢？”因为大脑受伤是第六意识的“浮尘根”遭到破坏，当然会影响神志，身的变化也会导致心的变化，不然“身心不二”就不成立。比如吸毒也能让生理产生变化，那是因为“心物一元”的道理，“外境”（物、色法）的变化如果不能让“身”和“心”都随之变化，则心物何来一元。修行的目的就是让“心”去变化“身”和“物”，而不让“心”被“身”和“物”变化。“心”变化了，出一些舍利子（身和物的变化）一点不稀奇。

唯识学将“心”分成八种识，修“心”的方法是将注意力集中在“六识”（意识）和“七识”（末那识，恒持我执）的转化上，但其转化的过程中，“五识”（眼耳鼻舌身五种识）和“八识”（阿赖耶识）也会随之转化，表现在外在的就是“身”和“外境”（色法）发生变化。说得学术化一点，六、七识的转化可得法身，五、八识的转化可得报身和化身，报身和化身的成就转化就包含了“身”和“外境”的变化。

所以一般修行都比较重视将注意力集中在“修心”上，说的就是去转化六、七识，并随之带动五、八识的转化。五识转化了叫“成所作智”，圆满了就会有前五种神通，六识转化了叫“妙观察智”，最重要的是转化第七识成“平等性智”，圆满后就叫“漏尽通”，这一通才是脱离轮回的关键。但也有一开始就去转化前五识，而后才去做六、七识的转化的。比如修行禅定，前五识发生变化，有了神通，然后可以比较轻松地进行六、七识的转化。

但无论是从“身”开始还是从“心”开始，最后之目的都是要明白“心”的真相，如果只将注意力集中在“身”和“外境”上，就成了“心外求法”，变外道了。比如练气功求身体健康，搞科学希望获得对物质（外境）的满足和知解。还有更具迷惑性的一些外道，靠打坐等一些禅定方法获得前五识的部分转化，得到一些神通，却不去求根本的“漏尽通”，虽然神通广大，但依然轮回。《楞严经》就是专讲如何识别这些外道的。所以叫“开悟的楞严”。

再具体一些，比如有人问：“为什么我们的睡眠和觉者的睡眠不同？睡眠在普通人看来就是一种本能和生理现象了，但在唯识学中，睡眠是一种“心所”（心产生的现象），叫“昏沉”，如果修心到一定的程度，六、七识清明转化到脱离了昏沉，就不需要睡眠了。但如果五、八识还未完全转化，身体依然需要睡眠，于是，很多觉悟者会用“心”看着自己的身体睡觉。而不修行的凡夫呢，身体睡眠，心亦昏沉。但到了八识完全转化，则身心合一，都不需要睡觉，即使是“睡”，那也是一种表演。

所有的“本能”和“生理”现象，在佛学中都有圆满的解说，比如“性”，如果修心完全脱离淫欲，绝对看到异性也不感兴趣，甚至在梦中都不起淫念。但这不代表八识得到全部转化，如果全部转化，则会如佛陀一样，身体成“马阴藏相”。饮食也如此，如果六、七识得以转变，吃任何东西都可以心无喜厌，但舌识毕竟知道苦乐，而到了八识全部转化，成就佛果时，则任何食品都成为绝顶美味，因为佛陀的界蕴处完全无下劣种子。但为什么佛陀还会有背痛、吃马麦、脚趾受伤等现象呢？因为众生需要，所以他如此示现，让大家明白因果的重要。